企业(中心)下属子企业上海南方基因科技有限企业拥有全世界第六套Illumina Beadlab System,建立了中国最大的大规模高效单核苷酸多态基因分型检测平台,并利用此平台出色地完成了国际HAPMAP计划21号染色体的SNP分型工作。企业还加入了上海研发公共服务平台共享网络,为国内外的生物医药行业科研单位、医学院校和医药企业以及欧美的大型制药企业提供了基因测序、STR全扫、SNP发掘、SNP分型和关联分析、mRNA表达谱、甲基化水平检测等技术服务,客户包括:GSK、Lilly、Merck、Prifer、强生等国际大型制药企业,平台每年能完成3万例样本的检测实验和技术服务。企业在DNA预警、诊断检测芯片的研发主要包括呼吸道病毒感染监测芯片、冠心病SNP预警芯片、无创产前基因诊断试剂盒和外周血游离核酸中大肠癌标记物检测技术的研发工作。

 

企业提供的Beadlab 服务主要包括:

 

SNP基因分型

 

人类基因分型

 

 

 

定制基因分型

 

       提供广泛的定制基因分型选项,包括Infinium iSelect HD、GoldenGate和VeraCode,适用于48至100万个变异的灵活设计,以便最契合您的研究。

 

SNaPshot -多重单碱基延伸SNP分型技术

 

       基于标记双脱氧核苷酸终止法,对引物进行单碱基延伸从而达到基因分型的目的。

       ● 中等通量,每次反应可以检测1-10个SNP位点。

       ● 灵活性高,同时检测基因组任何位置上的SNP位点,同时检测插入、缺失、碱基替换等各种类型的SNP。

       ● 过程易控,得到PCR产物后进行一次反应就能得到检测结果,减少实验操作中产生的误差,且可以质控保证数据质量。

       ● 直接检测,结果直观

       ● 多重检测,价格低廉

 

农业基因组学

       大家同时可提供Illumina合编辑基于Infinium技术研发的苹果,梨,樱桃,番茄,马铃薯,山羊SNP芯片等。

 

细胞遗传学

 

       cyto-SNP12 BeadChip

       主要用于细胞遗传学、疾病和肿瘤相关的变异分析等

       ● 12个样本一张芯片,约300000位点更好的解决小区域的 FISH or CGH.数据来源于HAPMAPI和II

       ● 检测具有高灵敏度和低噪音水平,50-mer的SNP探针为芯片提供了高信噪比以及整体的低噪音水平可实现精确,可靠的检出。

       ● 220000个标记为细胞遗传学分析提供有用的内容。密集覆盖约250个基因组区域通常由细胞遗传学实验室筛选,包括subtelomeric地区,pericentromeric地区,性染色体,和有针对性的400个疾病相关基因。

       ● 分析AppKaryostudio

 

 

       Cyto850K BeadChip

       主要用于细胞遗传学、发育迟缓和肿瘤相关的变异分析,包括CNV检测以及杂合性缺失(LOH)等

       ● 8个样本一张芯片,包含850K的SNPs(15x的重复率),覆盖3200多个与细胞遗传学、发育迟缓以及肿瘤相关的基因。

       ● 高密度的SNPs结合最新国际细胞遗传学以及同行评议文献,使其获得了更多关于染色体变异相关区域位点的检测。

       ● 检测具有高灵敏度和低噪音水平,50-mer的SNP探针为芯片提供了高信噪比以及整体的低噪音水平可实现精确,可靠的检出和拷贝数分析。

       ● CytoSNP-850K芯片是第一款利用最新细胞遗传学相关基因设计的SNP位点阵列,基因选自于临床基因组学国际合作(ICCG)、肿瘤细胞遗传学微阵列联盟(CCMC)以及Sanger。

       ● 分析AppBlueFuse Multi(根据研究结果不断在更新)

 

 

       HumanKaryomap-12 BeadChips

       覆盖基因组约30万个位点,12个样本一张芯片,采用单细胞SureMDA扩增获得较高质量的DNA,使用BlueFuse Multi分析App分析,可以筛选出携带有遗传自父母的单基因疾病的胚胎。

 

基因表达

 

       人表达谱芯片服务

       Illumina Human HT-12expression beadchip

       每张芯片可平行检测12个样本,包含有24,500个基因转录本,信息来源于NCBI RefSeq数据库。

 

 

       Illumina小鼠表达谱芯片服务

       Illumina Mouse WG-6 expression beadchip

       每张芯片可平行检测6个样本,包含45,200个基因转录本.,信息来源于NCBI RefSeq数据库。

 

       表观遗传学

       Illumina Human 甲基化450K芯片服务

       广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他疾病研究,是唯一一款适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。

       ● 12个样本一张芯片

       ● 覆盖全面:450,000多个甲基化位点

       ● 无需“甲基化DNA免疫共沉淀”,亚硫酸氢盐处理基因组DNA即可进行芯片实验

       ● Infinium探针设计,直接识别甲基化位点

       ● 技术重复相关系数R2 = 0.9969

       ● 与“全基因组亚硫酸氢盐-测序”相关系数R2 > 0.959。