基因芯片是功能基因组研究、药物基因组研究、疾病发病机理研究和系统生物学研究等的关键技术平台。特别是疾病的分子标志物发现、早期诊断和治疗、临床分型等是当前研究最为紧迫的。基因芯片的高通量、平行性在疾病研究如肿瘤等方面具有十分明显的优势,可以准确地反应病理组织中基因的表达状态。而且,芯片实验结果所涵盖的信息量远远大于传统方法,弥补了现有分型方法的不足,为疾病的针对性治疗提供了可能。


       企业(中心)在国家的支撑下,建立了系列的基因芯片技术平台,主要包括Affymetrix、Agilent、Illumina及SBC自制芯片检测平台。到2015年企业(中心)拥有国际先进的3套Affymetrix基因芯片检测与服务系统,配置了分子生物学用全自动液体处理机器人系统、高效样本制备仪、荧光定量PCR检测仪、安捷伦2100生物分析系统以及分子生物学实验所需要的各种仪器,具备了大规模基因测序、克隆构建、探针制备、基因芯片点制与检测全面操作能力。


       大家产品的服务对象主要是,各大院校及研究机构;各大医院的基础研究及临床研究;生命科学相关的国家级重点实验室;生命科学相关的部级、省、市级重点实验室;各制药厂进行药物筛选和毒理研究的部门;涉及农牧业、环境、海洋生物、林业等研究领域的研究机构;国外大型医药企业和研究机构。

 

高通量DNA甲基化


       企业(中心)建立和完善了DNA甲基化分析的研究平台,包括中低通量水平的MSP,BSP及MethyLight平台到全基因组大通量水平的illumina 450K芯片平台和MeDIP-seq平台;开发了用于甲基化DNA富集的免疫沉淀试剂盒;建立了DNA甲基化检测芯片的质量控制体系。进行了肿瘤及癌旁的全基因组甲基化芯片检测,完成了106对肿瘤及癌旁样品全基因组甲基化异化谱的分析,包括肝癌及癌旁组织,胰腺癌及癌旁组织,胃癌及癌旁组织等, 得到了一批在肿瘤中高甲基化的基因或位点,这些位点将是肿瘤早期诊断的候选甲基化分子标记。例如对肝癌和癌旁组织的研究,发现了2300个在30对样本中出现肝癌组织高甲基化的基因,这些基因可作为候选的肝癌诊断分子标记。这些有甲基化差异的CpG岛将会对肝癌甲基化异化谱的研究、肝癌的分期分型、设计肝癌检测芯片等提供有用信息。