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Shanghai Biochip Co., Ltd.
ATAC-SEQ测序技术先容
ATAC-SEQ,全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用Tn5转座酶结合到开放染色质上并酶切捕获暴露的DNA序列,然后使用高通量测序技术对捕获到的DNA序列进行建库测序。
实验流程
技术参数
推荐测序方式:illumina 测序平台,PE150,建议至少10G/每个样本
样本要求:新鲜细胞,数量1x103—1x105个;新鲜组织,质量为50mg/份
建议对有参考基因组的物种进行ATAC-SEQ
核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质结构。在复制和转录时高度折叠的染色质结构打开并暴露出DNA序列,这段DNA序列可被转录因子和其他调控原件结合,即染色质开放性。同时,这段裸露的DNA区域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。
概况
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